Új csapatsport a laborokban

Multidiszciplináris adatmenedzsment a gyógyszerkutatásban

Az új genomikai technológiák és a génszerkesztés révén a gyógyszerkutatás az adatkezelés átalakulásának egyik fő terepe. Mivel a laborok petabájt (10¹⁵ bájt) nagyságrendben termelik az adatokat, az információkezelés felelőssége az új gyógyszerek keresése során a központosított informatikai részlegekről egyre inkább a kutatócsoportokra hárul. Ez nagy változás mind a kutatók, mind az informatikai részlegek számára.

„Egyfolytában a digitalizáción dolgozunk, amióta csak ismerem a gyógyszeripart, és még mindig a digitális átalakulás a beszédtéma” – mondta Michael Montello, a GlaxoSmithKline kutatási és fejlesztési elnökhelyettese a Chemical & Engineering News nevű lapnak a legutóbbi Bio-IT World konferencia után. Az eseményen a Pfizer, a Roche és az Eli Lilly szakemberei is cégük adatmenedzsmentjének átalakulásáról adtak elő.

Feszített tempó

Nemcsak arról van szó, hogy megváltozott a kutatólaborok információtechnológiája a felhőalapú információtechnológia, valamint a mesterséges intelligencia és a gépi tanulás alkalmazása miatt. A gyógyszerkutatás információmenedzsmentjének átalakulását még ennél is jobban hajtja magának a tudománynak a fejlődése. „A tudományos innováció tempója messze túlszárnyalja az IT-innovációk sebességét. Olyan gyorsan fejlődik a tudomány, hogy az IT nem is tud lépést tartani az adattároló rendszerek és az analitikus környezet kialakítása iránti igényével” – magyarázza Chris Dagdigian, a BioTeam nevű IT-tanácsadó cég igazgatója az idézett cikkben.

123rf.com

Az elemzők szerint az átalakulással a kutatók visszaszerzik a kontrollt az általuk előállított adatok felett, bár eddig is közvetlenül részt vettek az IT-rendszerek fejlesztésében, és sok olyan feladatot vállaltak, amely hagyományosan a vállalati informatikai részlegek hatáskörébe tartozott. Ezzel párhuzamosan a hagyományosan centralizált laboratóriumi adatmenedzsment-infrastruktúra decentralizálódik, a kutatók adattudósokkal és szoftvermérnökökkel dolgoznak együtt. „Ma már olyan árnyalt az adatok használatának és elérésének módja, ami nem teszi lehetővé, hogy egy centralizált informatikai osztály egyszerűen bevezethető, szabályalapú döntéseket hozzon” – teszi hozzá Chris Dagdigian.

Kölcsönös tanulás

Mindazonáltal a digitális átalakulás nem egyszerűen az IT decentralizációját jelenti. A laborokban – a nagy gyógyszercégeknél, a startupoknál és az akadémiai kutatóintézetekben egyaránt – a kutatómunka minden szegmensében multidiszciplináris csapatok szerveződnek, amelyek együtt hozzák létre és fejlesztik tovább a saját maguk által használt adatkezelő rendszereket.

Mindez jóval nagyobb kreativitást biztosít, és a munka során a gyógyszerkutatók és az adattudósok egymástól is tanulhatnak. A kutatókat bevonják az adatmenedzsmentbe, az adattudósok pedig szert tesznek olyan ismeretekre, amelyek segítenek az IT-eszközök hatékonyabb laboratóriumi alkalmazásában. A kölcsönös tanulás a genomikai kutatásban a legnagyobb jelentőségű, ahol az IT-nek kulcsszerepe van a gyógyszeres támadáspontok azonosításában. Ramesh Durvasula, a Lilly IT-kutatási elnökhelyettese szerint az adatmenedzsment „csapatsporttá vált”. Hozzáteszi, a standardizáció azért jelent kihívást, mert egyre többféle adatot gyűjtenek, márpedig a versenyelőnyt jelentő modellek kialakításához szükséges az adathalmozás.

Okos keresés

Mások az informatika konzumizálódását hangsúlyozzák: egyrészt már az adatkezelő rendszerek is a felhőbe költöznek, másrészt a laboratóriumi felhasználók maguk végezhetik el a szoftverek konfigurálását, azaz ők állíthatják be, hogy azok hogyan működjenek. Az adatkeresés fejlődése is része az átalakulásnak: működnek olyan keresőmotorok, amelyek mesterséges intelligencia segítségével azonosítják egy betegség összes valaha publikált genetikai variánsát. Az adatokat a továbbiakban szakértői csapat értékeli, és a hozzájuk tartozó tudományos bizonyítékokkal együtt interpretálja.

Eközben a hagyományos laboratóriumi menedzsmentszoftvereknek sem alkonyult be: a LIMS-rendszer olyan fejlett konfigurációkkal frissült, amelyek lehetővé teszik a testreszabását. Vagyis az a tendencia, hogy a kutatók egyre inkább átveszik az irányítást az IT felett, nem jelent egzisztenciális fenyegetést a nagy adattároló rendszerekre. A legnagyobb gyógyszergyártó cégek is a hagyományos és az újonnan megjelenő adatkezelési technikák közötti egyensúly kialakításával támogatják a multidiszciplináris gyógyszerkutató csapatok igényeit.

Dr. Kazai Anita
orvos

Megjelent a Marketingpirula 2022. májusi számában.